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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
4565 6961 d 0 h maechler /trunk/Matrix/ merge 'branches/Matrix-APIchange' back into the trunk  
/trunk/Matrix/src/iohb.c
/trunk/Matrix/src/iohb.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/inst/doc/Comparisons.Rnw
/trunk/Matrix/inst/include/Matrix.h
/trunk/Matrix/inst/include/Matrix_stubs.c
/trunk/Matrix/src/CHMfactor.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/cs_utils.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.c
/trunk/Matrix/src/sparseQR.c
/trunk/Matrix/src/t_gCMatrix_colSums.c
4104 7118 d 21 h maechler /trunk/Matrix/ many more coercions for diag(), "!", etc; see ChangeLog  
/trunk/Matrix/src/TMatrix_as.c
/trunk/Matrix/src/TMatrix_as.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/Rsparse.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dpoMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ldenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ltTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ndenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/man/Cholesky-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Diagonal.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/RsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/Xtrct-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/bdiag.Rd
/trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/denseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dpoMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dtrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/ltrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4093 7125 d 0 h maechler /trunk/Matrix/src/ + SET_Dimnames; more dimnames setting and other cosmetic  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
3944 7207 d 4 h maechler /trunk/Matrix/ 2nd round of cleanup for <sparse>_validate()  
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
3523 7271 d 13 h bates /trunk/Matrix/src/ housekeeping  
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
3401 7288 d 23 h bates /trunk/Matrix/ Generalize conversions  
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3149 7375 d 10 h maechler /trunk/Matrix/ some "sparse <-> graph" updates  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/graph.R
2200 7497 d 20 h bates /trunk/Matrix/ Removing rcond slot from Matrix objects  
/trunk/Matrix/tests/dpoMatrix.Rout.save
/trunk/Matrix/src/Syms.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/dpoMatrix.R
/trunk/Matrix/tests/dtpMatrix.R
2022 7550 d 19 h bates /trunk/Matrix/ Matrix multiplication and coersion at higher level  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/TsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/denseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Makefile
/trunk/Matrix/src/Makefile.win
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dense.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
1830 7617 d 0 h bates /trunk/Matrix/ Added CHOLMOD-based C functions. Still need methods defined in R and some error checking  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Pattern.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/UMFPACK/Makefile
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1767 7638 d 18 h bates /trunk/Matrix/ clean up conversion of graphNEL to sparseMatrix  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
1765 7638 d 19 h maechler /trunk/Matrix/ prepare graphNEL coercion both for directed and undir.  
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1735 7647 d 19 h bates /trunk/Matrix/ Coercion method for graphNEL to sparseMatrix class  
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
1190 7818 d 23 h bates /trunk/Matrix/ Internationalization and localization  
/trunk/Matrix/inst/po
/trunk/Matrix/inst/po/LL
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES/Matrix.mo
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES/R-Matrix.mo
/trunk/Matrix/po
/trunk/Matrix/po/Matrix.pot
/trunk/Matrix/po/R-Matrix.pot
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/LU.h
/trunk/Matrix/src/cblas.h
/trunk/Matrix/src/flame.c
/trunk/Matrix/src/flame.h
/trunk/Matrix/src/ldl.c
/trunk/Matrix/src/ldl.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Doxyfile
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/ssclme.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
1044 7839 d 8 h maechler /trunk/Matrix/src/ use mkString(); "uplo" and "diag" must be uppercase  
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
987 7844 d 22 h bates /trunk/Matrix/src/ renaming and rearranging classes  
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscChol.c
/trunk/Matrix/src/sscChol.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
981 7845 d 1 h bates /trunk/Matrix/ renaming and rearranging classes  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
978 7845 d 2 h bates /trunk/Matrix/src/ Renaming and reorganizing classes  
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.h
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/geMatrix.c
/trunk/Matrix/src/geMatrix.h
/trunk/Matrix/src/poMatrix.c
/trunk/Matrix/src/poMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/syMatrix.c
/trunk/Matrix/src/syMatrix.h
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/trMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/src/triplet.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
977 7845 d 2 h bates /trunk/Matrix/src/ Renaming and reorganizing classes  
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/LU.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/cscBlocked.c
/trunk/Matrix/src/cscBlocked.h
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/geMatrix.c
/trunk/Matrix/src/geMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/poMatrix.c
/trunk/Matrix/src/poMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscChol.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/syMatrix.c
/trunk/Matrix/src/syMatrix.h
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/trMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/src/triplet.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
975 7845 d 5 h bates /trunk/Matrix/ Change name of slot from factorization to factors  
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/data/mm.rda
/trunk/Matrix/inst/doc/Introduction.Rnw
/trunk/Matrix/man/Cholesky-class.Rd
/trunk/Matrix/man/geMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/poMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sscChol-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sscCrosstab-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sscMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/syMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/trMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/tscMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Syms.h
/trunk/Matrix/src/cscBlocked.c
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/geMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/poMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/syMatrix.c
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/tests/poMatrix.R

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