R-packages – /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1387 – numeric x dgeMatrix : for solve etc; semi-activate the as.Matrix() ...

maechler — Mon, 18 Apr 2005 20:20:04 +0000

maechler – 2 file(s) modified
numeric x dgeMatrix : for solve etc; semi-activate the as.Matrix() idea

~ /trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1321 – Moving methods for operations with numeric to the Matrix class ...

bates — Thu, 31 Mar 2005 17:10:16 +0000

bates – 20 file(s) modified
Moving methods for operations with numeric to the Matrix class and with integer to the dMatrix class

~ /trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dpoMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dppMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dspMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
~ /trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
~ /trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
~ /trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
~ /trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
~ /trunk/Matrix/src/init.c

Rev 1314 – + virtual "sparseMatrix" classes

maechler — Sat, 26 Mar 2005 15:59:18 +0000

maechler – 6 file(s) modified
+ virtual "sparseMatrix" classes

~ /trunk/Matrix/ChangeLog
+ /trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/NAMESPACE
~ /trunk/Matrix/R/AllClass.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1288 – + as.matrix() + unname() method

maechler — Thu, 17 Mar 2005 17:52:06 +0000

maechler – 4 file(s) modified
+ as.matrix() + unname() method

~ /trunk/Matrix/ChangeLog
~ /trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/NAMESPACE
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1287 – more %*% and setAs(); tests too

maechler — Wed, 16 Mar 2005 16:57:52 +0000

maechler – 16 file(s) modified
more %*% and setAs(); tests too

~ /trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dsyMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dtpMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dtrMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/R/dMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dspMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
~ /trunk/Matrix/R/pMatrix.R
~ /trunk/Matrix/tests/dpoMatrix.R
~ /trunk/Matrix/tests/dpoMatrix.Rout.save
~ /trunk/Matrix/tests/dtpMatrix.R
~ /trunk/Matrix/tests/matprod.R
~ /trunk/Matrix/tests/validObj.R

Rev 1240 – extended show Method, testing for "Matrix"; rather "ddenseMatrix" -> "matrix"

maechler — Sat, 05 Mar 2005 21:20:42 +0000

maechler – 1 file(s) modified
extended show Method, testing for "Matrix"; rather "ddenseMatrix" -> "matrix"

~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1228 – - move dim, dimnames, dimnames<- methods from "dgeMatrix" to ...

maechler — Fri, 04 Mar 2005 17:33:03 +0000

maechler – 1 file(s) modified
- move dim, dimnames, dimnames<- methods from "dgeMatrix" to here
- setAs(* , to = "matrix")

~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 1175 – dimnames(), "dimnames() <-", better t(), etc

maechler — Sun, 27 Feb 2005 00:04:16 +0000

maechler – 9 file(s) modified
dimnames(), "dimnames() <-", better t(), etc

~ /trunk/Matrix/ChangeLog
~ /trunk/Matrix/DESCRIPTION
~ /trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/NAMESPACE
~ /trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
~ /trunk/Matrix/tests/validObj.R

Rev 1060 – add @Dimnames (-> new "mm")

maechler — Thu, 10 Feb 2005 13:50:27 +0000

maechler – 18 file(s) modified
add @Dimnames (-> new "mm")

~ /trunk/Matrix/data/mm.rda
~ /trunk/Matrix/Done
~ /trunk/Matrix/man/Cholesky-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dCholCMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dgBCMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
~ /trunk/Matrix/NAMESPACE
~ /trunk/Matrix/R/AllClass.R
~ /trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
~ /trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
~ /trunk/Matrix/tests/dpoMatrix.Rout.save
~ /trunk/Matrix/tests/matr-exp.R
~ /trunk/Matrix/tests/mm-redo.R
~ /trunk/Matrix/tests/validObj.R
~ /trunk/Matrix/TODO

Rev 1011 – better show(); using new option "max.print"

maechler — Fri, 04 Feb 2005 23:45:12 +0000

maechler – 2 file(s) modified
better show(); using new option "max.print"

~ /trunk/Matrix/ChangeLog
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 998 – - wrap line - if(.) style in as.Matrix()

maechler — Fri, 04 Feb 2005 18:16:32 +0000

maechler – 1 file(s) modified
- wrap line
- if(.) style in as.Matrix()

~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R

Rev 976 – Renaming and reorganizing classes

bates — Wed, 02 Feb 2005 14:14:59 +0000

bates – 22 file(s) modified
Renaming and reorganizing classes

~ /trunk/Matrix/R/AllClass.R
~ /trunk/Matrix/R/bCrosstab.R
~ /trunk/Matrix/R/cscBlocked.R
x /trunk/Matrix/R/cscMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/cscMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/geMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/tripletMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dpoMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/poMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/sscMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dsyMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/syMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/tscMatrix.R@964)
+ /trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R (copied from /trunk/Matrix/R/trMatrix.R@964)
~ /trunk/Matrix/R/eigen.R
x /trunk/Matrix/R/geMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
x /trunk/Matrix/R/poMatrix.R
~ /trunk/Matrix/R/sscCrosstab.R
x /trunk/Matrix/R/sscMatrix.R
x /trunk/Matrix/R/syMatrix.R
x /trunk/Matrix/R/tripletMatrix.R
x /trunk/Matrix/R/trMatrix.R
x /trunk/Matrix/R/tscMatrix.R

Rev 155 – Initial import

bates — Mon, 22 Mar 2004 20:20:05 +0000

bates – 264 file(s) modified
Initial import

+ /trunk/Matrix
+ /trunk/Matrix/ChangeLog
+ /trunk/Matrix/data
+ /trunk/Matrix/data/mm.rda
+ /trunk/Matrix/data/ScotsSec.rda
+ /trunk/Matrix/data/y.rda
+ /trunk/Matrix/DESCRIPTION
+ /trunk/Matrix/INDEX
+ /trunk/Matrix/inst
+ /trunk/Matrix/inst/doc
+ /trunk/Matrix/inst/doc/Comparisons.Rnw
+ /trunk/Matrix/inst/doc/Introduction.Rnw
+ /trunk/Matrix/inst/doc/Matrix.bib
+ /trunk/Matrix/inst/doc/MixedEffects.Rnw
+ /trunk/Matrix/inst/doc/myVignette.sty
+ /trunk/Matrix/install.R
+ /trunk/Matrix/man
+ /trunk/Matrix/man/Cholesky-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/coefGets.Rd
+ /trunk/Matrix/man/corFactor.Rd
+ /trunk/Matrix/man/corMatrix.Rd
+ /trunk/Matrix/man/corrmatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/cscMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/expand.Rd
+ /trunk/Matrix/man/facmul.Rd
+ /trunk/Matrix/man/geMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/Hilbert.Rd
+ /trunk/Matrix/man/isInitialized.Rd
+ /trunk/Matrix/man/LU-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/lu.Rd
+ /trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/Matrix.Rd
+ /trunk/Matrix/man/matrixGets.Rd
+ /trunk/Matrix/man/mm.Rd
+ /trunk/Matrix/man/norm.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdBlocked-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdCompSymm-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdDiag-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdfactor-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdFactor.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdIdent-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdLogChol-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdMat-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdmatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdMatrix.Rd
+ /trunk/Matrix/man/pdNatural-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/poMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/rcond.Rd
+ /trunk/Matrix/man/Schur.Rd
+ /trunk/Matrix/man/ScotsSec.Rd
+ /trunk/Matrix/man/sscChol-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/sscCrosstab-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/sscCrosstab.Rd
+ /trunk/Matrix/man/ssclme-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/sscMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/syMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/tripletMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/trMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/tscMatrix-class.Rd
+ /trunk/Matrix/man/unpack.Rd
+ /trunk/Matrix/man/y.Rd
+ /trunk/Matrix/NAMESPACE
+ /trunk/Matrix/R
+ /trunk/Matrix/R/AAA.R
+ /trunk/Matrix/R/AllClass.R
+ /trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
+ /trunk/Matrix/R/cscMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/eigen.R
+ /trunk/Matrix/R/geMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/Hilbert.R
+ /trunk/Matrix/R/LU.R
+ /trunk/Matrix/R/Matrix.R
+ /trunk/Matrix/R/pdCompSymm.R
+ /trunk/Matrix/R/pdDiag.R
+ /trunk/Matrix/R/pdIdent.R
+ /trunk/Matrix/R/pdLogChol.R
+ /trunk/Matrix/R/pdMat.R
+ /trunk/Matrix/R/pdNatural.R
+ /trunk/Matrix/R/poMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/sscCrosstab.R
+ /trunk/Matrix/R/sscMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/syMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/tripletMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/trMatrix.R
+ /trunk/Matrix/R/tscMatrix.R
+ /trunk/Matrix/src
+ /trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/dense.c
+ /trunk/Matrix/src/dense.h
+ /trunk/Matrix/src/factorizations.c
+ /trunk/Matrix/src/factorizations.h
+ /trunk/Matrix/src/flame.c
+ /trunk/Matrix/src/flame.h
+ /trunk/Matrix/src/geMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/geMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/geMutils.c
+ /trunk/Matrix/src/geMutils.h
+ /trunk/Matrix/src/ldl.c
+ /trunk/Matrix/src/ldl.h
+ /trunk/Matrix/src/LU.c
+ /trunk/Matrix/src/LU.h
+ /trunk/Matrix/src/Makefile
+ /trunk/Matrix/src/Makefile.win
+ /trunk/Matrix/src/Metis
+ /trunk/Matrix/src/Metis/balance.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/bucketsort.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/ccgraph.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/coarsen.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/compress.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/debug.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/defs.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/estmem.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/fm.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/fortran.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/frename.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/graph.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/initpart.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kvmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kwayfm.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kwayrefine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kwayvolfm.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/kwayvolrefine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/macros.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/Makefile
+ /trunk/Matrix/src/Metis/Makefile.win
+ /trunk/Matrix/src/Metis/match.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mbalance.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mbalance2.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mcoarsen.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/memory.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mesh.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/meshpart.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/metis.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mfm.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mfm2.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mincover.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/minitpart.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/minitpart2.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mkmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mkwayfmh.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mkwayrefine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mmatch.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mmd.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mpmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mrefine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mrefine2.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/mutil.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/myqsort.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/ometis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/parmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/pmetis.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/pqueue.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/proto.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/refine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/rename.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/separator.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/sfm.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/srefine.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/stat.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/struct.h
+ /trunk/Matrix/src/Metis/subdomains.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/timing.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis/util.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis_utils.c
+ /trunk/Matrix/src/Metis_utils.h
+ /trunk/Matrix/src/Mutils.c
+ /trunk/Matrix/src/Mutils.h
+ /trunk/Matrix/src/pdDiag.c
+ /trunk/Matrix/src/pdIdent.c
+ /trunk/Matrix/src/pdLogChol.c
+ /trunk/Matrix/src/pdMat.c
+ /trunk/Matrix/src/pdNatural.c
+ /trunk/Matrix/src/poMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/poMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/sscChol.c
+ /trunk/Matrix/src/sscChol.h
+ /trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
+ /trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
+ /trunk/Matrix/src/ssclme.c
+ /trunk/Matrix/src/ssclme.h
+ /trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/syMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/syMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/taucs
+ /trunk/Matrix/src/taucs/Makefile
+ /trunk/Matrix/src/taucs/Makefile.win
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs.h
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_ccs_base.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_ccs_factor_llt.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_ccs_ops.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_ccs_solve_llt.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_ccs_xxt.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_complex.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_config_build.h
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_config_tests.h
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_malloc.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_private.h
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_sn_llt.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs/taucs_vec_base.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs_utils.c
+ /trunk/Matrix/src/taucs_utils.h
+ /trunk/Matrix/src/triplet.c
+ /trunk/Matrix/src/triplet.h
+ /trunk/Matrix/src/trMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/trMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
+ /trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/amd.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/amd_internal.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/Makefile
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/Makefile.win
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/UMFPACK.README
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_col_to_triplet.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_defaults.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_free_numeric.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_free_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_get_lunz.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_get_numeric.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_get_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_load_numeric.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_load_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_control.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_info.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_matrix.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_numeric.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_perm.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_status.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_triplet.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_report_vector.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_save_numeric.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_save_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_scale.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_solve.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_symbolic.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_tictoc.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_timer.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_transpose.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_triplet_to_col.c
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umfpack_triplet_to_col.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_config.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_dump.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_free.c
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_free.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_internal.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_malloc.c
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_malloc.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_triplet.c
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_triplet.h
+ /trunk/Matrix/src/umfpack/umf_version.h
+ /trunk/Matrix/src/utils.c
+ /trunk/Matrix/tests
+ /trunk/Matrix/tests/cscMatrix.R
+ /trunk/Matrix/tests/pdCompSymm.R
+ /trunk/Matrix/tests/pdDiag.R
+ /trunk/Matrix/tests/pdIdent.R
+ /trunk/Matrix/tests/pdLogChol.R
+ /trunk/Matrix/tests/pdNatural.R
+ /trunk/Matrix/tests/poMatrix.R