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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
7488 3082 d 20 h ripley /branches/R-3-4-branch/ baseline for nlme in 3.4.x, starting with 3.1-131  
/branches/R-3-4-branch
5003 6704 d 14 h maechler /trunk/Matrix/ .symDiagonal(), is.na() and more diagonalMatrix "Ops"  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/doc/Announce.txt
/trunk/Matrix/man/Diagonal.Rd
/trunk/Matrix/man/diagonalMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4994 6705 d 15 h maechler /trunk/Matrix/ my fast determinant(<dsC..>) versions  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/man/CHMfactor-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Cholesky.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/factorizing.R
4979 6716 d 5 h maechler /trunk/Matrix/ diagN2U() for preserving (unit-)triangularity in sparse (triang.)matrix multiplication  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4972 6718 d 15 h maechler /trunk/Matrix/ use diagU2N in more places; also new Tsparse_diagU2N()  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtTMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
4953 6734 d 4 h maechler /trunk/Matrix/ miscellaneous cleanup; typically indexing and coercion  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/Rsparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/triangularMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/doc/Intro2Matrix.Rnw
/trunk/Matrix/man/band.Rd
/trunk/Matrix/man/dtCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/symmetricMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/triangularMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4734 6921 d 14 h bates /trunk/Matrix/ Remove deprecated function writeHB and its methods; switch writeMM to use CHOLMOD code; repair readMM  
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.h
/trunk/Matrix/src/mmio.c
/trunk/Matrix/src/mmio.h
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/HBMM.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/man/externalFormats.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
4573 6959 d 14 h maechler /trunk/Matrix/ Rsparse validation methods; finally make use of slot_dup() macro; fix R_to_C (symmetric)  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/man/band.Rd
/trunk/Matrix/man/dgRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dtRMatrix-class-def.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/TMatrix_as.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/ldense.c
4565 6960 d 20 h maechler /trunk/Matrix/ merge 'branches/Matrix-APIchange' back into the trunk  
/trunk/Matrix/src/iohb.c
/trunk/Matrix/src/iohb.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/inst/doc/Comparisons.Rnw
/trunk/Matrix/inst/include/Matrix.h
/trunk/Matrix/inst/include/Matrix_stubs.c
/trunk/Matrix/src/CHMfactor.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/cs_utils.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.c
/trunk/Matrix/src/sparseQR.c
/trunk/Matrix/src/t_gCMatrix_colSums.c
4500 6973 d 19 h maechler /trunk/Matrix/ colSums() etc update (fix for lgC*)  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/t_gCMatrix_colSums.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4456 6983 d 2 h maechler /trunk/Matrix/ more strict validity checking for Csparse  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4418 6992 d 20 h bates /trunk/Matrix/src/ Remove warnings after change to const char* CHAR  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
4109 7117 d 19 h maechler /trunk/Matrix/ drop(); tweaks to Ops & indexing; Rsparse coercions for less exceptions in tests/Class+Meth.R  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/Rsparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix.Rd
/trunk/Matrix/man/RsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseQR-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4093 7124 d 20 h maechler /trunk/Matrix/src/ + SET_Dimnames; more dimnames setting and other cosmetic  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
4055 7152 d 21 h maechler /trunk/Matrix/ more "[<-" fixes; validity of triangular sparse  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4052 7156 d 17 h maechler /trunk/Matrix/ rbind2() / cbind2() methods fixes + new Auxiliaries  
/trunk/Matrix/R/bind2.R
/trunk/Matrix/man/atomicVector-class.Rd
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/diagonalMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/tests/bind.R
/trunk/Matrix/tests/bind.Rout.save
3943 7207 d 2 h maechler /trunk/Matrix/ tcrossprod(<Csp>, <Csp>); dimnames for [t]crossprod; validity now ensures correct length(Dimnames[[j]])  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.h
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3942 7207 d 19 h maechler /trunk/Matrix/ extend Csparse_Csparse_crossprod for tcrossprod (need test!); isSymmetric improved; misc.  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3940 7207 d 20 h bates /trunk/Matrix/ crossprod(<CsparseMatrix>,<CsparseMatrix>) added  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
3931 7212 d 20 h maechler /trunk/Matrix/ miscellaneous "fixes" mostly in ChangeLog and/or related to diagonalMatrix  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/HBMM.R
/trunk/Matrix/R/Hilbert.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsyMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ddenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ddiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/diagonalMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
/trunk/Matrix/tests/validObj.R

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