The R Project SVN R-packages

Rev

Hide changed files | Details | Compare with Previous | Blame | RSS feed

Filtering Options

Rev Age Author Path Log message Diff Changes
3548 7267 d 15 h bates /branches/Matrix-nolmer/ New branch for bringing lmer C code back into lme4  
/branches/Matrix-nolmer
3406 7286 d 13 h bates /trunk/Matrix/src/ Utilities Csparse_to_logical and Csparse_symmetric_to_general  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
3404 7286 d 15 h bates /trunk/Matrix/ Use CHOLMOD code for general methods at CsparseMatrix, TsparseMatrix, denseMatrix or matrix level when possible  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
3401 7288 d 17 h bates /trunk/Matrix/ Generalize conversions  
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3134 7377 d 12 h bates /trunk/Matrix/ Generics lowerTriMatrix and upperTriMatrix and C function Csparse_band  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2304 7461 d 12 h bates /trunk/Matrix/ Used cholmod_vertcat and cholmod_horzcat for cbind2 and rbind2 in the dsparseMatrix virtual class  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2030 7545 d 18 h bates /trunk/Matrix/src/ Added crossprod method for Csparse and dense  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2022 7550 d 12 h bates /trunk/Matrix/ Matrix multiplication and coersion at higher level  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/TsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/denseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Makefile
/trunk/Matrix/src/Makefile.win
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dense.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
1836 7615 d 13 h bates /trunk/Matrix/ crossprod and tcrossprod for Tsparse  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
1831 7616 d 11 h bates /trunk/Matrix/ More progress on incorporating CHOLMOD - still not passing CMD check  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/gTMatrix.R
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/dgTMatrix.R
1830 7616 d 18 h bates /trunk/Matrix/ Added CHOLMOD-based C functions. Still need methods defined in R and some error checking  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Pattern.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/UMFPACK/Makefile
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c