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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
1929 7583 d 20 h bates /branches/Matrix-mer2/ Incorporating CHOLMOD-based lmer  
/branches/Matrix-mer2
1876 7602 d 14 h bates /trunk/Matrix/ Modifications to mer2  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/lmer.R
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
1864 7606 d 20 h maechler /trunk/Matrix/src/ packed_to_full_(double|int) and full_to_packed_*  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ldense.c
1862 7607 d 3 h maechler /trunk/Matrix/src/ use uplo_P() and diag_P() macros instead of *_value() functions  
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
1854 7607 d 7 h maechler /trunk/Matrix/src/ + uplo_value(), diag_value()  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
1785 7631 d 18 h maechler /trunk/Matrix/src/ comments  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
1735 7647 d 18 h bates /trunk/Matrix/ Coercion method for graphNEL to sparseMatrix class  
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
1577 7719 d 17 h bates /trunk/Matrix/src/ Isolating and cleaning up the mer, lmer, and glmer functions  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
1572 7721 d 0 h bates /trunk/Matrix/src/ Keep -Wall quiet  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
1536 7740 d 22 h bates /trunk/Matrix/src/ Added Matrix_expand_pointers (callable from R) and moved utility for duplicating slots  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
1381 7770 d 1 h bates /trunk/Matrix/ Release 0.95-6  
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.c
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
1226 7814 d 22 h maechler /trunk/Matrix/src/ do not Calloc()/Free() in "good" case of check_scalar_string()  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
1209 7815 d 20 h bates /trunk/Matrix/ Methods and coercions for the dtpMatrix class  
/trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dtpMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/tests/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dtrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1203 7816 d 10 h bates /trunk/Matrix/src/ Clean up *_validate functions  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
1199 7816 d 21 h bates /trunk/Matrix/src/ shorten csc_components_transpose to csc_compTr  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
1190 7818 d 21 h bates /trunk/Matrix/ Internationalization and localization  
/trunk/Matrix/inst/po
/trunk/Matrix/inst/po/LL
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES/Matrix.mo
/trunk/Matrix/inst/po/LL/LC_MESSAGES/R-Matrix.mo
/trunk/Matrix/po
/trunk/Matrix/po/Matrix.pot
/trunk/Matrix/po/R-Matrix.pot
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/LU.h
/trunk/Matrix/src/cblas.h
/trunk/Matrix/src/flame.c
/trunk/Matrix/src/flame.h
/trunk/Matrix/src/ldl.c
/trunk/Matrix/src/ldl.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Doxyfile
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.c
/trunk/Matrix/src/factorizations.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/ssclme.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
1054 7837 d 7 h bates /trunk/Matrix/ rearranging utility functions in the C code  
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/R/dgBCMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
1044 7839 d 7 h maechler /trunk/Matrix/src/ use mkString(); "uplo" and "diag" must be uppercase  
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
992 7843 d 21 h bates /trunk/Matrix/src/ Move the make_named function to Mutils as Matrix_make_named  
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
987 7844 d 20 h bates /trunk/Matrix/src/ renaming and rearranging classes  
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscChol.c
/trunk/Matrix/src/sscChol.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h

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