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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
4529 6966 d 3 h bates /branches/Matrix-APIchange/ Creating a branch for the API changes from the 0.99875 series to the 0.999375 series  
/branches/Matrix-APIchange
3950 7205 d 18 h maechler /trunk/Matrix/ fully-sparse solve() for dsC; indexing & comparison fixes  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
/trunk/Matrix/tests/validObj.R
3944 7207 d 4 h maechler /trunk/Matrix/ 2nd round of cleanup for <sparse>_validate()  
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
3514 7272 d 17 h bates /trunk/Matrix/src/ Remove vestigial classed argument for dsCMatrix_matrix_solve  
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
3477 7277 d 19 h bates /trunk/Matrix/ Add Cholesky generic and method for dsCMatrix. Use CHOLMOD for chol().  
/trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
3465 7278 d 18 h bates /trunk/Matrix/src/ Comment out vestigial functions  
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
3410 7285 d 23 h maechler /trunk/Matrix/ eliminate sCMatrix_to_gCMatrix now that we have (almost identical) Csparse_symmetric_to_general  
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1856 7607 d 8 h maechler /trunk/Matrix/src/ + logical dense matrices; more coercions  
/trunk/Matrix/src/ldense.c
/trunk/Matrix/src/ldense.h
/trunk/Matrix/src/LDL/Makefile
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
1830 7617 d 0 h bates /trunk/Matrix/ Added CHOLMOD-based C functions. Still need methods defined in R and some error checking  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Pattern.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/UMFPACK/Makefile
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1321 7788 d 0 h bates /trunk/Matrix/ Moving methods for operations with numeric to the Matrix class and with integer to the dMatrix class  
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dpoMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dppMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dspMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
987 7844 d 22 h bates /trunk/Matrix/src/ renaming and rearranging classes  
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dCholCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscChol.c
/trunk/Matrix/src/sscChol.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
978 7845 d 2 h bates /trunk/Matrix/src/ Renaming and reorganizing classes  
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix_to_dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.h
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/geMatrix.c
/trunk/Matrix/src/geMatrix.h
/trunk/Matrix/src/poMatrix.c
/trunk/Matrix/src/poMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/syMatrix.c
/trunk/Matrix/src/syMatrix.h
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/trMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/src/triplet.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
977 7845 d 2 h bates /trunk/Matrix/src/ Renaming and reorganizing classes  
/trunk/Matrix/src/LU.c
/trunk/Matrix/src/LU.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/bCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/cscBlocked.c
/trunk/Matrix/src/cscBlocked.h
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/geMatrix.c
/trunk/Matrix/src/geMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/poMatrix.c
/trunk/Matrix/src/poMatrix.h
/trunk/Matrix/src/sscChol.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/syMatrix.c
/trunk/Matrix/src/syMatrix.h
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/trMatrix.h
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/src/triplet.h
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
804 7904 d 3 h bates /trunk/Matrix/src/ R-specific versions of ldl  
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
466 8007 d 15 h bates /trunk/Matrix/ Remove taucs, add lmeRep, new release  
/trunk/Matrix/man/lmeRep-class.Rd
/trunk/Matrix/src/taucs
/trunk/Matrix/src/taucs_utils.c
/trunk/Matrix/src/taucs_utils.h
/trunk/Matrix/src/utils.c
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/man/sscChol-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Makefile
/trunk/Matrix/src/Makefile.win
/trunk/Matrix/src/cscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/lmeRep.c
/trunk/Matrix/src/lmeRep.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
364 8088 d 23 h bates /trunk/Matrix/src/ Combine the two ldl_symbolic routines  
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
306 8115 d 21 h bates /trunk/Matrix/src/ Add routines to project and ldl_symbolic the ctab  
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
301 8120 d 4 h bates /trunk/Matrix/src/ Rearranging code to isolate Metis includes  
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.c
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.h
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.c
/trunk/Matrix/src/sscCrosstab.h
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
218 8141 d 5 h bates /trunk/Matrix/ Adding coercions - fixing bugs  
/trunk/Matrix/R/sscMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ssclme.R
/trunk/Matrix/R/tripletMatrix.R
/trunk/Matrix/R/tscMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.c
/trunk/Matrix/src/Metis_utils.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h
/trunk/Matrix/src/ssclme.c
/trunk/Matrix/src/ssclme.h
/trunk/Matrix/src/trMatrix.c
/trunk/Matrix/src/triplet.c
/trunk/Matrix/src/triplet.h
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.c
/trunk/Matrix/src/tscMatrix.h
197 8147 d 14 h bates /trunk/Matrix/src/ Lack of inclusion picked up by -Wall  
/trunk/Matrix/src/sscMatrix.h

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