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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
4529 6966 d 4 h bates /branches/Matrix-APIchange/ Creating a branch for the API changes from the 0.99875 series to the 0.999375 series  
/branches/Matrix-APIchange
4104 7118 d 21 h maechler /trunk/Matrix/ many more coercions for diag(), "!", etc; see ChangeLog  
/trunk/Matrix/src/TMatrix_as.c
/trunk/Matrix/src/TMatrix_as.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/Rsparse.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dpoMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtrMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ldenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ltTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ndenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/man/Cholesky-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Diagonal.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/RsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/Xtrct-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/bdiag.Rd
/trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/denseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dpoMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsRMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dtrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/ltrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/dtpMatrix.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3944 7207 d 4 h maechler /trunk/Matrix/ 2nd round of cleanup for <sparse>_validate()  
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.h
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
3883 7229 d 2 h bates /trunk/Matrix/ Remove Harwell-Boeing format for writing  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
3730 7262 d 4 h bates /trunk/Matrix/src/ Remove dependencies on triplet_to_col and its source files  
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.c
/trunk/Matrix/src/triplet_to_col.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.h
3678 7265 d 23 h bates /trunk/Matrix/ Merging changes from Matrix-nolmer branch  
/trunk/Matrix/R/lmer.R
/trunk/Matrix/R/pedigree.R
/trunk/Matrix/data/sleepstudy.rda
/trunk/Matrix/man/BIC.Rd
/trunk/Matrix/man/VarCorr-class.Rd
/trunk/Matrix/man/VarCorr.Rd
/trunk/Matrix/man/fixef.Rd
/trunk/Matrix/man/hatTrace.Rd
/trunk/Matrix/man/lmer-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lmer.Rd
/trunk/Matrix/man/mcmcsamp.Rd
/trunk/Matrix/man/pedigree-class.Rd
/trunk/Matrix/man/pedigree.Rd
/trunk/Matrix/man/ranef.Rd
/trunk/Matrix/man/sleepstudy.Rd
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
/trunk/Matrix/src/pedigree.c
/trunk/Matrix/src/pedigree.h
/trunk/Matrix/tests/lmer.R
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/Syms.h
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.h
3489 7276 d 23 h bates /trunk/Matrix/src/ Replaced R_ldl etc. by CHOLMOD functions  
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
3475 7277 d 20 h bates /trunk/Matrix/ Remove classes lCholCMatrix and dCholCMatrix, now using CHMfactor classes instead  
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
3438 7281 d 14 h bates /trunk/Matrix/ Added methods for sparseQR for qr.qy, qr.qty, qr.coef, qr.resid and qr.fitted  
/trunk/Matrix/R/sparseQR.R
/trunk/Matrix/src/sparseQR.c
/trunk/Matrix/src/sparseQR.h
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
3331 7314 d 23 h bates /trunk/Matrix/ Add coersion from CHMfactor to sparseMatrix  
/trunk/Matrix/R/CHMfactor.R
/trunk/Matrix/src/CHMfactor.c
/trunk/Matrix/src/CHMfactor.h
/trunk/Matrix/man/CHMfactor-class.Rd
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
3111 7393 d 2 h bates /trunk/Matrix/ Add chol method for pedigree objects  
/trunk/Matrix/src/pedigree.c
/trunk/Matrix/src/pedigree.h
/trunk/Matrix/R/pedigree.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
3069 7408 d 4 h bates /trunk/Matrix/src/ Add CSparse library and utilities  
/trunk/Matrix/src/cs.c
/trunk/Matrix/src/cs.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/cs_utils.h
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
2173 7501 d 14 h bates /trunk/Matrix/src/ Remove dgBCMatrix.[ch] and dependencies  
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgBCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
1856 7607 d 9 h maechler /trunk/Matrix/src/ + logical dense matrices; more coercions  
/trunk/Matrix/src/ldense.c
/trunk/Matrix/src/ldense.h
/trunk/Matrix/src/LDL/Makefile
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
1851 7608 d 17 h bates /trunk/Matrix/ Temporary function mer2 to experiment with CHOLMOD-based mixed-effects  
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/Makefile.bak
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/lmer.R
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lmer.c
/trunk/Matrix/src/lmer.h
1830 7617 d 1 h bates /trunk/Matrix/ Added CHOLMOD-based C functions. Still need methods defined in R and some error checking  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Pattern.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/UMFPACK/Makefile
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
1828 7618 d 22 h bates /trunk/Matrix/src/ Some CHOLMOD utilities  
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
1820 7620 d 3 h bates /trunk/Matrix/src/ Adding CHOLMOD and related source packages  
/trunk/Matrix/src/AMD
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/AMD_UserGuide.bib
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/AMD_UserGuide.pdf
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/AMD_UserGuide.tex
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/ChangeLog
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/License
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/Makefile
/trunk/Matrix/src/AMD/Doc/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/AMD/Include
/trunk/Matrix/src/AMD/Include/amd.h
/trunk/Matrix/src/AMD/Lib
/trunk/Matrix/src/AMD/Makefile
/trunk/Matrix/src/AMD/README.txt
/trunk/Matrix/src/AMD/Source
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/GNUmakefile
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/Makefile.bak
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_1.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_2.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_aat.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_control.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_defaults.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_dump.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_global.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_info.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_internal.h
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_order.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_post_tree.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_postorder.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_preprocess.c
/trunk/Matrix/src/AMD/Source/amd_valid.c
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/ChangeLog
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/Makefile
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/README.txt
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/ccolamd.c
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/ccolamd.h
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/ccolamd_global.c
/trunk/Matrix/src/CCOLAMD/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Check
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Check/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Check/cholmod_check.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Check/cholmod_read.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Check/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_amd.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_analyze.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_colamd.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_etree.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_factorize.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_postorder.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rcond.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_resymbol.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowcolcounts.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowfac.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_solve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/cholmod_spsolve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/debug_c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/t_cholmod_lsolve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/t_cholmod_ltsolve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/t_cholmod_rowfac.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Cholesky/t_cholmod_solve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_aat.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_add.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_band.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_change_factor.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_common.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_complex.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_copy.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_dense.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_error.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_factor.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_memory.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_sparse.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_transpose.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/cholmod_triplet.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/t_cholmod_change_factor.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/t_cholmod_dense.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/t_cholmod_transpose.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Core/t_cholmod_triplet.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Makefile
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/0.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/bcsstk01.rsa
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/bcsstk01.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/bcsstk02.rsa
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/bcsstk02.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/c.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/c.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/can___24.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/d.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/empty.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/lp_afiro.rra
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/lp_afiro.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle1.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle2.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle3.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle4.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle5.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle6.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle7.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/mangle8.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/n5
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/one.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/pts5ldd03.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/Matrix/up.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/cholmod_demo.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/cholmod_demo.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/cholmod_l_demo.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/cholmod_simple.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/ghs_yifan
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/gpl.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/make.out
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/reade.f
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/readhb.f
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Demo/readhb2.f
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/Makefile
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/UserGuide.bib
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/UserGuide.pdf
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/UserGuide.tex
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/footer.tex
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/getmproto
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/getproto
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/header.tex
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/mfile.awk
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/mfooter.tex
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/mheader.tex
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Doc/rule.awk
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/README.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_blas.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_check.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_cholesky.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_complexity.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_config.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_core.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_internal.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_matrixops.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_modify.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_partition.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_supernodal.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Include/cholmod_template.h
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Lib
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Lib/Makefile
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Makefile
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_drop.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_horzcat.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_norm.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_scale.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_sdmult.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_ssmult.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_submatrix.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_vertcat.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/gpl.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/MatrixOps/t_cholmod_sdmult.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/cholmod_rowadd.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/cholmod_rowdel.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/cholmod_updown.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/gpl.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/t_cholmod_updown.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Modify/t_cholmod_updown_numkr.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/cholmod_ccolamd.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/cholmod_csymamd.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/cholmod_metis.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/cholmod_nesdis.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Partition/lesser.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/README.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_numeric.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_solve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_symbolic.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/gpl.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/t_cholmod_super_numeric.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Supernodal/t_cholmod_super_solve.c
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/License.txt
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Makefile
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/0
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/0_1
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/1_0
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/2.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/20lo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/2_3
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/2diag.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/2lo.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/2up.tri
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/3_2
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/3singular
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/4
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/4lo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/5
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/a1
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/a2
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/afiro
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c10
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c30lo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c30up
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c3singular
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c5lo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/c5up
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/cpi
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/cs.mtx
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/diag
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/ex5lo
/trunk/Matrix/src/CHOLMOD/Tcov/Matrix/galenet
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