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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
4529 6966 d 3 h bates /branches/Matrix-APIchange/ Creating a branch for the API changes from the 0.99875 series to the 0.999375 series  
/branches/Matrix-APIchange
3942 7207 d 23 h maechler /trunk/Matrix/ extend Csparse_Csparse_crossprod for tcrossprod (need test!); isSymmetric improved; misc.  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3940 7208 d 0 h bates /trunk/Matrix/ crossprod(<CsparseMatrix>,<CsparseMatrix>) added  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
3876 7234 d 1 h maechler /trunk/Matrix/ Matrix(0, d,d) should also give sparse (not diagonal); general_to_symmetric; notably for lsC*; more coercions; first cut at Csparse_drop()  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix.Rd
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3755 7258 d 18 h maechler /trunk/Matrix/ new nMatrix and subclasses; lsparse change to have x slot; many consequences  
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ndenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntTMatrix.R
/trunk/Matrix/man/nMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ngeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/nsyMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ntrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ldenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/doc/Intro2Matrix.Rnw
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/man/CHMfactor-class.Rd
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/band.Rd
/trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dtCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/lsyMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/ldense.c
/trunk/Matrix/src/ldense.h
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3406 7286 d 19 h bates /trunk/Matrix/src/ Utilities Csparse_to_logical and Csparse_symmetric_to_general  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
3404 7286 d 21 h bates /trunk/Matrix/ Use CHOLMOD code for general methods at CsparseMatrix, TsparseMatrix, denseMatrix or matrix level when possible  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
3401 7288 d 23 h bates /trunk/Matrix/ Generalize conversions  
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3134 7377 d 18 h bates /trunk/Matrix/ Generics lowerTriMatrix and upperTriMatrix and C function Csparse_band  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllGeneric.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2304 7461 d 18 h bates /trunk/Matrix/ Used cholmod_vertcat and cholmod_horzcat for cbind2 and rbind2 in the dsparseMatrix virtual class  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2030 7546 d 0 h bates /trunk/Matrix/src/ Added crossprod method for Csparse and dense  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
2022 7550 d 18 h bates /trunk/Matrix/ Matrix multiplication and coersion at higher level  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/TsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/denseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Makefile
/trunk/Matrix/src/Makefile.win
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dense.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
1836 7615 d 19 h bates /trunk/Matrix/ crossprod and tcrossprod for Tsparse  
/trunk/Matrix/INDEX
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
1831 7616 d 17 h bates /trunk/Matrix/ More progress on incorporating CHOLMOD - still not passing CMD check  
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/gTMatrix.R
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/dgTMatrix.R
1830 7617 d 0 h bates /trunk/Matrix/ Added CHOLMOD-based C functions. Still need methods defined in R and some error checking  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/Tsparse.h
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Pattern.c
/trunk/Matrix/src/SOURCES_C.mkf
/trunk/Matrix/src/UMFPACK/Makefile
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c