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Rev Age Author Path Log message Diff Changes
4558 6961 d 5 h maechler /branches/Matrix-APIchange/ more R_CheckStack()s  
/branches/Matrix-APIchange/inst/doc/Comparisons.Rnw
/branches/Matrix-APIchange/src/CHMfactor.c
/branches/Matrix-APIchange/src/Csparse.c
/branches/Matrix-APIchange/src/Tsparse.c
/branches/Matrix-APIchange/src/chm_common.c
/branches/Matrix-APIchange/src/chm_common.h
/branches/Matrix-APIchange/src/dense.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dgCMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dsCMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dtTMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/sparseQR.c
/branches/Matrix-APIchange/src/t_gCMatrix_colSums.c
4530 6966 d 5 h bates /branches/Matrix-APIchange/ API change - pass the empty structure to the as_cholmod_x functions  
/branches/Matrix-APIchange/DESCRIPTION
/branches/Matrix-APIchange/inst/include/Matrix.h
/branches/Matrix-APIchange/inst/include/Matrix_stubs.c
/branches/Matrix-APIchange/src/CHMfactor.c
/branches/Matrix-APIchange/src/Csparse.c
/branches/Matrix-APIchange/src/Mutils.h
/branches/Matrix-APIchange/src/Tsparse.c
/branches/Matrix-APIchange/src/chm_common.c
/branches/Matrix-APIchange/src/chm_common.h
/branches/Matrix-APIchange/src/dense.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dgCMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dsCMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/dtTMatrix.c
/branches/Matrix-APIchange/src/t_gCMatrix_colSums.c
4529 6966 d 5 h bates /branches/Matrix-APIchange/ Creating a branch for the API changes from the 0.99875 series to the 0.999375 series  
/branches/Matrix-APIchange
4500 6974 d 1 h maechler /trunk/Matrix/ colSums() etc update (fix for lgC*)  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/DEPS.mkf
/trunk/Matrix/src/t_gCMatrix_colSums.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4456 6983 d 8 h maechler /trunk/Matrix/ more strict validity checking for Csparse  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/man/dgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4418 6993 d 1 h bates /trunk/Matrix/src/ Remove warnings after change to const char* CHAR  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/HBMM.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dpoMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dppMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dspMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsyMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtpMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtrMatrix.c
4109 7118 d 1 h maechler /trunk/Matrix/ drop(); tweaks to Ops & indexing; Rsparse coercions for less exceptions in tests/Class+Meth.R  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Ops.R
/trunk/Matrix/R/Rsparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix.Rd
/trunk/Matrix/man/RsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseQR-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4093 7125 d 2 h maechler /trunk/Matrix/src/ + SET_Dimnames; more dimnames setting and other cosmetic  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/cs_utils.c
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dgTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
4055 7153 d 3 h maechler /trunk/Matrix/ more "[<-" fixes; validity of triangular sparse  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
/trunk/Matrix/tests/simple.R
4052 7156 d 23 h maechler /trunk/Matrix/ rbind2() / cbind2() methods fixes + new Auxiliaries  
/trunk/Matrix/R/bind2.R
/trunk/Matrix/man/atomicVector-class.Rd
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/diagonalMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/tests/bind.R
/trunk/Matrix/tests/bind.Rout.save
3943 7207 d 8 h maechler /trunk/Matrix/ tcrossprod(<Csp>, <Csp>); dimnames for [t]crossprod; validity now ensures correct length(Dimnames[[j]])  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.h
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3942 7208 d 1 h maechler /trunk/Matrix/ extend Csparse_Csparse_crossprod for tcrossprod (need test!); isSymmetric improved; misc.  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/init.c
3940 7208 d 2 h bates /trunk/Matrix/ crossprod(<CsparseMatrix>,<CsparseMatrix>) added  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
3931 7213 d 2 h maechler /trunk/Matrix/ miscellaneous "fixes" mostly in ChangeLog and/or related to diagonalMatrix  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/Done
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/HBMM.R
/trunk/Matrix/R/Hilbert.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgeMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsyMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ddenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ddiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/diagonalMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/sparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgeMatrix.c
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R
/trunk/Matrix/tests/validObj.R
3876 7234 d 3 h maechler /trunk/Matrix/ Matrix(0, d,d) should also give sparse (not diagonal); general_to_symmetric; notably for lsC*; more coercions; first cut at Csparse_drop()  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsCMatrix.R
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix.Rd
/trunk/Matrix/man/Subassign-methods.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/tests/simple.R
3835 7241 d 9 h maechler /trunk/Matrix/src/ comments & not_yet code  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
3791 7252 d 4 h maechler /trunk/Matrix/ check 'x' slot in l.CMatrix_validate  
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/ddenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/diagMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ldenseMatrix.R
/trunk/Matrix/TODO
/trunk/Matrix/man/dsCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
/trunk/Matrix/tests/indexing.R
/trunk/Matrix/tests/indexing.Rout.save
3784 7254 d 3 h maechler /trunk/Matrix/src/ update for "l"Matrix cholmod-handling  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
3766 7257 d 4 h bates /trunk/Matrix/src/ Move checks on column sorting of CsparseMatrix objects to Csparse_validate  
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.c
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dgCMatrix.h
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/lgCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/lsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/ltCMatrix.c
3755 7258 d 20 h maechler /trunk/Matrix/ new nMatrix and subclasses; lsparse change to have x slot; many consequences  
/trunk/Matrix/R/lMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ndenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ngTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/nsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ntTMatrix.R
/trunk/Matrix/man/nMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ndiMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ngeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/nsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/nsyMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ntrMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/ChangeLog
/trunk/Matrix/DESCRIPTION
/trunk/Matrix/NAMESPACE
/trunk/Matrix/R/AllClass.R
/trunk/Matrix/R/Auxiliaries.R
/trunk/Matrix/R/Csparse.R
/trunk/Matrix/R/Matrix.R
/trunk/Matrix/R/Tsparse.R
/trunk/Matrix/R/dMatrix.R
/trunk/Matrix/R/denseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dsCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/dtCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/ldenseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgCMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lgTMatrix.R
/trunk/Matrix/R/lsparseMatrix.R
/trunk/Matrix/R/pMatrix.R
/trunk/Matrix/R/sparseMatrix.R
/trunk/Matrix/inst/doc/Intro2Matrix.Rnw
/trunk/Matrix/inst/test-tools.R
/trunk/Matrix/man/CHMfactor-class.Rd
/trunk/Matrix/man/CsparseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/Matrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/band.Rd
/trunk/Matrix/man/dMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dgCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/dtCMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/ldenseMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lgeMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/lsparseMatrix-classes.Rd
/trunk/Matrix/man/lsyMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/man/pMatrix-class.Rd
/trunk/Matrix/src/Csparse.c
/trunk/Matrix/src/Csparse.h
/trunk/Matrix/src/Mutils.h
/trunk/Matrix/src/Tsparse.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.c
/trunk/Matrix/src/chm_common.h
/trunk/Matrix/src/dense.c
/trunk/Matrix/src/dsCMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dsTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/dtTMatrix.c
/trunk/Matrix/src/init.c
/trunk/Matrix/src/ldense.c
/trunk/Matrix/src/ldense.h
/trunk/Matrix/tests/Class+Meth.R
/trunk/Matrix/tests/matprod.R
/trunk/Matrix/tests/simple.R

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