#!/bin/csh
setenv DISPLAY :5
limit cputime 10m
setenv _R_CHECK_FORCE_SUGGESTS_ FALSE
setenv LC_CTYPE en_GB
setenv RMPI_INCLUDE /usr/include/openmpi-x86_64
setenv RMPI_LIB_PATH /usr/lib64/openmpi/lib
setenv RMPI_TYPE OPENMPI
setenv R_BROWSER false
setenv R_PDFVIEWER false
setenv OMP_NUM_THREADS 2
setenv OMP_THREAD_LIMIT 2
setenv _R_CHECK_INSTALL_DEPENDS_ true
setenv _R_CHECK_SUGGESTS_ONLY_ true
#setenv _R_CHECK_NO_RECOMMENDED_ true
setenv _R_CHECK_DEPRECATED_DEFUNCT_ true
setenv _R_CHECK_CODE_ASSIGN_TO_GLOBALENV_ true
setenv _R_CHECK_CODE_ATTACH_ true
setenv _R_CHECK_CODE_DATA_INTO_GLOBALENV_ true
setenv _R_CHECK_TIMINGS_ 10
setenv _R_CHECK_DOC_SIZES2_ true
setenv _R_CHECK_FF_CALLS_ registration
setenv _R_CHECK_SCREEN_DEVICE_ warn
setenv _R_CHECK_REPLACING_IMPORTS_ true
setenv _R_CHECK_TOPLEVEL_FILES_ true
setenv _R_CHECK_CODE_USAGE_WITH_ONLY_BASE_ATTACHED_ TRUE

setenv WNHOME /usr/share/wordnet-3.0


setenv R_LIBS ~/R/test-3.3:~/R/test-Omegahat

foreach f ($*)
  ~/R/R-devel/bin/Rscript ~/R/packages/incoming/checkDeps.R $f
  ~/R/packages/incoming/pkgdiff $f
end