#!/bin/csh
setenv DISPLAY :5
limit cputime 30m
setenv OMP_THREAD_LIMIT 2

setenv _R_CHECK_FORCE_SUGGESTS_ FALSE
setenv LC_CTYPE en_GB.UTF-8
setenv RMPI_TYPE OPENMPI
setenv R_BROWSER false
setenv R_PDFVIEWER false
setenv OMP_NUM_THREADS 2
#setenv _R_CHECK_INSTALL_DEPENDS_ true
setenv _R_CHECK_SUGGESTS_ONLY_ true
setenv _R_CHECK_NO_RECOMMENDED_ true
#setenv _R_CHECK_DOC_SIZES2_ true
setenv _R_CHECK_TIMINGS_ 10
setenv _R_CHECK_DEPRECATED_DEFUNCT_ true
setenv _R_CHECK_CODE_ASSIGN_TO_GLOBALENV_ true
setenv _R_CHECK_CODE_DATA_INTO_GLOBALENV_ true
setenv _R_CHECK_SCREEN_DEVICE_ warn
setenv _R_CHECK_S3_METHODS_NOT_REGISTERED_ true
setenv _R_CHECK_OVERWRITE_REGISTERED_S3_METHODS_ true
#setenv _R_CHECK_CODE_USAGE_WITH_ONLY_BASE_ATTACHED_ TRUE
setenv _R_CHECK_NATIVE_ROUTINE_REGISTRATION_ true
setenv _R_CHECK_FF_CALLS_ registration
setenv _R_CHECK_PRAGMAS_ true
setenv _R_CHECK_COMPILATION_FLAGS_ true
setenv _R_CHECK_COMPILATION_FLAGS_KNOWN_ "-Wconversion -Wno-sign-conversion -Werror=implicit-function-declaration"
setenv _R_CHECK_THINGS_IN_TEMP_DIR_ true
setenv _R_CHECK_THINGS_IN_TEMP_DIR_EXCLUDE_ "^ompi"

setenv _R_CHECK_LIMIT_CORES_ true
setenv _R_CHECK_VIGNETTES_SKIP_RUN_MAYBE_ true
setenv _R_CHECK_TESTS_NLINES_ 0
setenv _R_CHECK_VIGNETTES_NLINES_ 0

setenv _R_CHECK_ELAPSED_TIMEOUT_ 30m
setenv _R_CHECK_INSTALL_ELAPSED_TIMEOUT_ 120m
setenv _R_CHECK_TESTS_ELAPSED_TIMEOUT_ 90m
setenv _R_CHECK_BUILD_VIGNETTES_ELAPSED_TIMEOUT_ 90m

setenv R_CRAN_WEB http://cran.r-project.org
setenv _R_CHECK_ORPHANED_ true

setenv NOAWT 1
setenv RGL_USE_NULL true
setenv PG_INCDIR libpq
setenv ODBC_INCLUDE /Users/ripley/Sources/iodbc/include
setenv WNHOME /usr/local/wordnet-3.1
setenv FONTCONFIG_PATH /opt/X11/lib/X11/fontconfig

setenv _R_CHECK_XREFS_USE_ALIASES_FROM_CRAN_ TRUE

nohup make -j10 -k check >&! check_log